More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1200 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  89.78 
 
 
313 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  51.15 
 
 
299 aa  298  7e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  45.21 
 
 
312 aa  298  8e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  51.14 
 
 
303 aa  296  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  50.36 
 
 
290 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  49.28 
 
 
310 aa  295  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 
297 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  49.08 
 
 
288 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  49.24 
 
 
303 aa  289  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  49.06 
 
 
290 aa  288  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  52.11 
 
 
276 aa  287  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  47.55 
 
 
298 aa  285  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  48.67 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  45.02 
 
 
321 aa  279  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  48.12 
 
 
285 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.03 
 
 
427 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  48.69 
 
 
289 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  46.99 
 
 
280 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  49.06 
 
 
285 aa  267  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  46.97 
 
 
273 aa  265  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.59 
 
 
418 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.07 
 
 
423 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.13 
 
 
479 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  49.03 
 
 
291 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.15 
 
 
424 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.78 
 
 
423 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
299 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  46.32 
 
 
318 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.35 
 
 
424 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 
318 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.66 
 
 
423 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  43.61 
 
 
297 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  44.94 
 
 
275 aa  255  8e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.65 
 
 
475 aa  255  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 
297 aa  254  9e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  47.9 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.06 
 
 
522 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.87 
 
 
424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.06 
 
 
499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.04 
 
 
518 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  43.23 
 
 
297 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.76 
 
 
500 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.02 
 
 
484 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.36 
 
 
655 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.86 
 
 
464 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.62 
 
 
483 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.39 
 
 
518 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.81 
 
 
531 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  43.56 
 
 
297 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.98 
 
 
518 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.49 
 
 
495 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  45.76 
 
 
520 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  49.81 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.4 
 
 
420 aa  244  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.86 
 
 
491 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.86 
 
 
491 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.84 
 
 
527 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.04 
 
 
519 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  44.13 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.8 
 
 
522 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.28 
 
 
520 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.28 
 
 
468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.8 
 
 
527 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.02 
 
 
529 aa  242  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  46.1 
 
 
473 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.91 
 
 
519 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.01 
 
 
423 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.65 
 
 
535 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.27 
 
 
351 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.91 
 
 
531 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  46.1 
 
 
296 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  43.91 
 
 
503 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  43.56 
 
 
304 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  41.16 
 
 
491 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.8 
 
 
503 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.16 
 
 
491 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.54 
 
 
498 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.26 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.38 
 
 
489 aa  232  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.65 
 
 
490 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.8 
 
 
498 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.91 
 
 
363 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.39 
 
 
482 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.14 
 
 
491 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.28 
 
 
495 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.8 
 
 
490 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.97 
 
 
490 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  46.1 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  47.73 
 
 
325 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 
269 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.89 
 
 
419 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.22 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.36 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.8 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.69 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  27.04 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.7 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>