121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3098 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  951    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.99 
 
 
427 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.54 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.05 
 
 
423 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.59 
 
 
423 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.58 
 
 
423 aa  392  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.89 
 
 
424 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.21 
 
 
423 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.09 
 
 
424 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.67 
 
 
424 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.63 
 
 
420 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  45.79 
 
 
310 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  47.17 
 
 
275 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  53.36 
 
 
293 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.15 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.85 
 
 
520 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.66 
 
 
491 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.66 
 
 
491 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.56 
 
 
518 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.47 
 
 
522 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.83 
 
 
527 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.47 
 
 
475 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.26 
 
 
483 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  39.73 
 
 
503 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.64 
 
 
468 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  40 
 
 
520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.85 
 
 
503 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.46 
 
 
522 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.44 
 
 
519 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.46 
 
 
499 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.73 
 
 
518 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.4 
 
 
479 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.61 
 
 
464 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 
299 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  45.49 
 
 
303 aa  264  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  44.91 
 
 
297 aa  264  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.06 
 
 
655 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.86 
 
 
527 aa  262  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  44.74 
 
 
298 aa  262  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 
299 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.28 
 
 
519 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.92 
 
 
484 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.28 
 
 
518 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.5 
 
 
500 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  44.49 
 
 
304 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  55.17 
 
 
325 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  42.76 
 
 
303 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.47 
 
 
489 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.32 
 
 
469 aa  256  8e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  44.61 
 
 
312 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.78 
 
 
535 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  45.52 
 
 
321 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.11 
 
 
490 aa  253  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  50.57 
 
 
296 aa  253  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.34 
 
 
531 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.58 
 
 
531 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.04 
 
 
498 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.57 
 
 
482 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.34 
 
 
491 aa  246  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.04 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  40.4 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.9 
 
 
498 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  46.1 
 
 
313 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  46.84 
 
 
313 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38 
 
 
490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.22 
 
 
495 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  46.59 
 
 
273 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.22 
 
 
491 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 
290 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  45.45 
 
 
276 aa  236  7e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.36 
 
 
351 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 
297 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 
297 aa  229  8e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  44.19 
 
 
290 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  42.7 
 
 
285 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 
297 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 
285 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.14 
 
 
490 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 
297 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.13 
 
 
363 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  42.44 
 
 
288 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  41.28 
 
 
297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 
289 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  40.51 
 
 
285 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  38.35 
 
 
318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 
280 aa  217  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  42.53 
 
 
291 aa  216  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  45.8 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  43.89 
 
 
296 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  40.58 
 
 
318 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 
307 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 
269 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.95 
 
 
419 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1151  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor NifB/Y/X family protein  30.65 
 
 
134 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0839  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.92 
 
 
113 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  19.42 
 
 
318 aa  54.3  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
266 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
361 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
266 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>