More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0843 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  100 
 
 
418 aa  855    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.61 
 
 
427 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.3 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.1 
 
 
423 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.24 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.23 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.48 
 
 
423 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.52 
 
 
424 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  60.69 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.38 
 
 
420 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.31 
 
 
424 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.33 
 
 
475 aa  329  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.65 
 
 
479 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  55.09 
 
 
275 aa  317  3e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.74 
 
 
489 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.12 
 
 
495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.52 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.52 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.4 
 
 
484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.05 
 
 
518 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.23 
 
 
655 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.46 
 
 
522 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.81 
 
 
483 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.55 
 
 
464 aa  310  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  42.09 
 
 
520 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.23 
 
 
518 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40 
 
 
522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.36 
 
 
520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.2 
 
 
518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.05 
 
 
519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.66 
 
 
503 aa  302  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.71 
 
 
468 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.63 
 
 
519 aa  299  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.76 
 
 
500 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.13 
 
 
527 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.24 
 
 
527 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  54.72 
 
 
296 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  52.19 
 
 
293 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.75 
 
 
482 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.47 
 
 
491 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  37.23 
 
 
491 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.8 
 
 
490 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  39.95 
 
 
503 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  50.55 
 
 
299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.01 
 
 
469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.02 
 
 
498 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.76 
 
 
498 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.99 
 
 
491 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.89 
 
 
535 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.19 
 
 
531 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.71 
 
 
529 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  48.52 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 
297 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  49.81 
 
 
303 aa  272  9e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.1 
 
 
531 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  49.63 
 
 
304 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 
313 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.04 
 
 
495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.54 
 
 
490 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  47.96 
 
 
312 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.38 
 
 
490 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  47.79 
 
 
321 aa  266  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  53.08 
 
 
325 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.08 
 
 
351 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 
313 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  47.04 
 
 
299 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  46.1 
 
 
303 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  49.27 
 
 
310 aa  261  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.08 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  44.44 
 
 
276 aa  254  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  46.32 
 
 
290 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 
288 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  45.62 
 
 
285 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  46.07 
 
 
297 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  44.68 
 
 
289 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  45.35 
 
 
285 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  43.35 
 
 
280 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  44.94 
 
 
290 aa  242  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  44.98 
 
 
297 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  45.26 
 
 
285 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  43.27 
 
 
297 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 
318 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  42.8 
 
 
273 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  44.49 
 
 
318 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  44.07 
 
 
297 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  42.96 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  42.59 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 
296 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  41.51 
 
 
331 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  41.06 
 
 
307 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.41 
 
 
419 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1151  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor NifB/Y/X family protein  39.26 
 
 
134 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0839  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.5 
 
 
113 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 
339 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.22 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.62 
 
 
338 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.94 
 
 
355 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>