155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1241 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  93.28 
 
 
491 aa  912    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  93.48 
 
 
491 aa  914    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  100 
 
 
491 aa  1008    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  62.55 
 
 
503 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  62.92 
 
 
490 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  66.22 
 
 
498 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.74 
 
 
498 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.44 
 
 
490 aa  581  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.35 
 
 
531 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.01 
 
 
522 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.8 
 
 
518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.23 
 
 
499 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.78 
 
 
522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.49 
 
 
518 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  57.83 
 
 
520 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.08 
 
 
520 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.8 
 
 
518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.6 
 
 
531 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.92 
 
 
529 aa  558  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.91 
 
 
519 aa  555  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.52 
 
 
527 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.35 
 
 
519 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  54.53 
 
 
475 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.75 
 
 
535 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.07 
 
 
479 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.93 
 
 
489 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.05 
 
 
484 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.12 
 
 
483 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.59 
 
 
495 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55 
 
 
490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.8 
 
 
491 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.8 
 
 
491 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  57.78 
 
 
503 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  54.34 
 
 
500 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.55 
 
 
527 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.78 
 
 
655 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.53 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.21 
 
 
464 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.6 
 
 
495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.24 
 
 
469 aa  449  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.4 
 
 
363 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.96 
 
 
468 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  62.41 
 
 
351 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  47.97 
 
 
299 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  45.42 
 
 
304 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.23 
 
 
418 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  44.17 
 
 
321 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.85 
 
 
427 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  42.76 
 
 
312 aa  267  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  45.68 
 
 
303 aa  266  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  43.31 
 
 
299 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.66 
 
 
423 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 
303 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  44.44 
 
 
298 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.01 
 
 
423 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 
297 aa  252  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.86 
 
 
424 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.3 
 
 
423 aa  250  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 
275 aa  249  6e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  42.4 
 
 
310 aa  249  8e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.38 
 
 
424 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.78 
 
 
424 aa  246  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.68 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
473 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  44.44 
 
 
290 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.1 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  45.26 
 
 
273 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 
288 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  43.37 
 
 
285 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 
285 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 
290 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  45.49 
 
 
289 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  45.15 
 
 
296 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 
313 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 
313 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  43.82 
 
 
280 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  43.01 
 
 
276 aa  223  8e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  40.97 
 
 
297 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  48.47 
 
 
325 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  41.7 
 
 
285 aa  217  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 
297 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 
297 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  41.28 
 
 
293 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 
297 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  36.9 
 
 
297 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 
318 aa  204  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  39.43 
 
 
331 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  36.57 
 
 
291 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  39.01 
 
 
296 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  36.03 
 
 
318 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  36.82 
 
 
307 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 
269 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.34 
 
 
419 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  35.78 
 
 
120 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2803  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  37.23 
 
 
109 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2272  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.64496  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3488  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40 
 
 
109 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0673  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.78 
 
 
109 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.67 
 
 
109 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.61 
 
 
109 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>