More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1056 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  100 
 
 
280 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  54.26 
 
 
299 aa  296  4e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  53.82 
 
 
285 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  53.05 
 
 
285 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  53.82 
 
 
289 aa  288  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  52.67 
 
 
290 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  51.94 
 
 
303 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  51.33 
 
 
276 aa  279  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  53.05 
 
 
273 aa  278  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  50.76 
 
 
288 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  49.62 
 
 
313 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  51.53 
 
 
290 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  51.53 
 
 
297 aa  275  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  51.55 
 
 
303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  49.04 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  46.24 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  48.26 
 
 
298 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  49.22 
 
 
297 aa  269  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  46.99 
 
 
313 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  48.08 
 
 
310 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.69 
 
 
479 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.44 
 
 
475 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  45.98 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.69 
 
 
519 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.07 
 
 
529 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.44 
 
 
464 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.64 
 
 
495 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.57 
 
 
468 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.32 
 
 
499 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.32 
 
 
522 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.32 
 
 
522 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  44.94 
 
 
520 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.32 
 
 
520 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  45.04 
 
 
275 aa  245  6e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.76 
 
 
655 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.32 
 
 
531 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  44.01 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.9 
 
 
351 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.39 
 
 
527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.57 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.35 
 
 
418 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.19 
 
 
518 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.9 
 
 
535 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.82 
 
 
500 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.15 
 
 
518 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.15 
 
 
518 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.78 
 
 
519 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.82 
 
 
531 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.82 
 
 
483 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.82 
 
 
491 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.82 
 
 
491 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  43.07 
 
 
296 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.07 
 
 
484 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.73 
 
 
423 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  44.57 
 
 
503 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.87 
 
 
424 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.32 
 
 
427 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.4 
 
 
363 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.27 
 
 
482 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  44.49 
 
 
304 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.57 
 
 
491 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.07 
 
 
498 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  44.57 
 
 
491 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.7 
 
 
490 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.21 
 
 
423 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.97 
 
 
424 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.59 
 
 
423 aa  228  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.35 
 
 
424 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.28 
 
 
503 aa  225  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.61 
 
 
490 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 
318 aa  224  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.61 
 
 
469 aa  224  9e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  40.3 
 
 
291 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.11 
 
 
420 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.15 
 
 
495 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.82 
 
 
491 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.3 
 
 
489 aa  222  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.32 
 
 
490 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.57 
 
 
498 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 
473 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.06 
 
 
423 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  42.91 
 
 
331 aa  214  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  42.8 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  41.2 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  41.29 
 
 
297 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 
297 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  44.62 
 
 
325 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  39.08 
 
 
297 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 
318 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  38.93 
 
 
297 aa  205  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 
293 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 
269 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.17 
 
 
419 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.88 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.47 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.31 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.29 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.11 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>