202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5111 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  75.9 
 
 		 522 aa  818    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  76.48 
 
 		 519 aa  786    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  69.09 
 
 		 529 aa  712    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  75.15 
 
 		 522 aa  803    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  91.28 
 
 		 518 aa  993    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  83.59 
 
 		 518 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  69.57 
 
 		 531 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  74.3 
 
 		 527 aa  792    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  88.72 
 
 		 519 aa  933    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  66.53 
 
 		 531 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  65.03 
 
 		 535 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  100 
 
 		 518 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  74.9 
 
 		 520 aa  815    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  74.7 
 
 		 520 aa  805    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  75.35 
 
 		 499 aa  802    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  60.81 
 
 		 484 aa  621  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  64.89 
 
 		 498 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.66 
 
 		 498 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.32 
 
 		 490 aa  609  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  60.38 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.21 
 
 		 479 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  61.16 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.4 
 
 		 475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.57 
 
 		 491 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.57 
 
 		 491 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.38 
 
 		 489 aa  595  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.63 
 
 		 503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.37 
 
 		 490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.14 
 
 		 655 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  60.43 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  56.96 
 
 		 491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.76 
 
 		 491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.76 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  54.06 
 
 		 527 aa  549  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.56 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.02 
 
 		 500 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  54.66 
 
 		 495 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.16 
 
 		 482 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.81 
 
 		 490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.74 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.5 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  61.08 
 
 		 351 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.1 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  52.3 
 
 		 299 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.23 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  48.49 
 
 		 304 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.72 
 
 		 427 aa  299  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  50.54 
 
 		 303 aa  296  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  48.06 
 
 		 312 aa  293  6e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  49.1 
 
 		 321 aa  292  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  47.87 
 
 		 299 aa  292  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.98 
 
 		 423 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.36 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.18 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  47.65 
 
 		 297 aa  286  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.94 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  48.2 
 
 		 298 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  47.65 
 
 		 303 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.07 
 
 		 424 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.06 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  46.18 
 
 		 310 aa  278  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 473 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.03 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  48.01 
 
 		 290 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.12 
 
 		 423 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 		 273 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  46.59 
 
 		 285 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  46.57 
 
 		 290 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  45.88 
 
 		 285 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  45.25 
 
 		 313 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  46.01 
 
 		 288 aa  256  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  45.55 
 
 		 289 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  45.39 
 
 		 313 aa  250  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 		 296 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 275 aa  244  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  45.15 
 
 		 280 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  43.22 
 
 		 276 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 297 aa  237  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  42.8 
 
 		 297 aa  236  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 		 285 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  46.95 
 
 		 325 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 		 297 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  41.79 
 
 		 291 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  38.49 
 
 		 318 aa  229  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 		 297 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 293 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  39.73 
 
 		 296 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  39.44 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  38.41 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  37.1 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  32.83 
 
 		 269 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 		 419 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  44.23 
 
 		 120 aa  97.4  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2272  hypothetical protein  33.96 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.64496  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3488  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.77 
 
 		 109 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0673  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.45 
 
 		 109 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2599  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.43 
 
 		 127 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.67 
 
 		 109 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.2 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>