More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2814 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  66.89 
 
 
304 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  54.55 
 
 
475 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.87 
 
 
479 aa  331  8e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53 
 
 
518 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.18 
 
 
484 aa  321  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.01 
 
 
522 aa  318  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  51.35 
 
 
520 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.3 
 
 
518 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.35 
 
 
520 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.25 
 
 
518 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.74 
 
 
519 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.04 
 
 
489 aa  314  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.34 
 
 
527 aa  312  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.99 
 
 
500 aa  311  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.84 
 
 
495 aa  311  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.68 
 
 
529 aa  311  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.88 
 
 
490 aa  310  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.69 
 
 
483 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.42 
 
 
519 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.66 
 
 
522 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.17 
 
 
655 aa  308  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.66 
 
 
499 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.65 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  48.65 
 
 
491 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.66 
 
 
531 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.02 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.8 
 
 
503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.5 
 
 
351 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.34 
 
 
491 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.34 
 
 
491 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.16 
 
 
469 aa  301  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.53 
 
 
498 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.97 
 
 
491 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.18 
 
 
498 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.65 
 
 
490 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.66 
 
 
468 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.64 
 
 
531 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.82 
 
 
490 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.81 
 
 
527 aa  295  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.55 
 
 
482 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.44 
 
 
495 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  51.28 
 
 
503 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.72 
 
 
363 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.26 
 
 
535 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.55 
 
 
418 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  49.27 
 
 
321 aa  279  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  47.14 
 
 
312 aa  278  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  49.26 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  46.91 
 
 
310 aa  267  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  48.15 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  48.52 
 
 
297 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 
473 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 
299 aa  264  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  48.11 
 
 
275 aa  263  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.35 
 
 
427 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  48.87 
 
 
313 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
313 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  46.21 
 
 
285 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 
296 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.44 
 
 
424 aa  255  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.48 
 
 
423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  47.08 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  46.07 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  45.02 
 
 
298 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.75 
 
 
423 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.76 
 
 
423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  45.39 
 
 
289 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 
290 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.81 
 
 
424 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.03 
 
 
423 aa  248  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  44.52 
 
 
288 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  45.42 
 
 
290 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 
297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.75 
 
 
424 aa  245  8e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  46.67 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  44.01 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 
325 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 
297 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.59 
 
 
420 aa  240  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  43.21 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  42.5 
 
 
297 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  44.49 
 
 
276 aa  235  9e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  42.54 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 
285 aa  228  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  44.23 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  41.97 
 
 
318 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  38.73 
 
 
331 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 
296 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  41.42 
 
 
307 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
269 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.09 
 
 
419 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.52 
 
 
322 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.87 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>