More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  73.09 
 
 
500 aa  719    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
503 aa  1042    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  61.08 
 
 
522 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  61.05 
 
 
520 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.84 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.04 
 
 
522 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.58 
 
 
518 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  61.79 
 
 
519 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  60.89 
 
 
531 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  60.13 
 
 
520 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.04 
 
 
499 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  61.81 
 
 
529 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.97 
 
 
531 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  60.44 
 
 
518 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.35 
 
 
527 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.9 
 
 
519 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.26 
 
 
535 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.72 
 
 
484 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.23 
 
 
498 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.59 
 
 
464 aa  541  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.16 
 
 
655 aa  537  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.51 
 
 
503 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.89 
 
 
498 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.79 
 
 
491 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.15 
 
 
475 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  54.6 
 
 
483 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.13 
 
 
491 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.6 
 
 
489 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  54.93 
 
 
491 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.06 
 
 
527 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.24 
 
 
490 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.21 
 
 
479 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.88 
 
 
495 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.9 
 
 
491 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.9 
 
 
491 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.68 
 
 
490 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  52.13 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.55 
 
 
495 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.08 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.55 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.99 
 
 
468 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  60.62 
 
 
351 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.36 
 
 
363 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.6 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  50.88 
 
 
303 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 
299 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.31 
 
 
427 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.14 
 
 
418 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  49.48 
 
 
303 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  47.22 
 
 
310 aa  290  4e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  48.56 
 
 
297 aa  290  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.84 
 
 
423 aa  287  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 
299 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.25 
 
 
423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.44 
 
 
424 aa  286  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.02 
 
 
424 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 
304 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.57 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  46.59 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  44.56 
 
 
312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  45.85 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.28 
 
 
420 aa  273  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
473 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.79 
 
 
423 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 
288 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  46.18 
 
 
290 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 
290 aa  260  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 
275 aa  259  9e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 
273 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  46.35 
 
 
296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  45.79 
 
 
297 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  45.26 
 
 
313 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  44.09 
 
 
289 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  44.57 
 
 
280 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  44.36 
 
 
285 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 
313 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  44.65 
 
 
285 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  42.55 
 
 
285 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  41.7 
 
 
276 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  46.97 
 
 
325 aa  237  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 
293 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  40.96 
 
 
297 aa  223  9e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 
318 aa  219  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 
297 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 
297 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 
296 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  40.67 
 
 
291 aa  216  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  40.86 
 
 
331 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 
318 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 
307 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
269 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.17 
 
 
419 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  39.09 
 
 
120 aa  86.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3488  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.76 
 
 
109 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.6 
 
 
109 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2080  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.59 
 
 
109 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2803  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  37.78 
 
 
109 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.96 
 
 
109 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>