84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2080 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2080  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  95.41 
 
 		 109 aa  214  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3488  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  65.14 
 
 		 109 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0673  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  61.47 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  60.55 
 
 		 109 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2803  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  55.96 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0631  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.44 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2103  putative nitrogen fixation protein  38.24 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  40.59 
 
 		 503 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  40.74 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.2 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.66 
 
 		 527 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.45 
 
 		 495 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.36 
 
 		 655 aa  68.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.67 
 
 		 479 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.61 
 
 		 483 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 		 491 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 		 491 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.67 
 
 		 484 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.56 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.94 
 
 		 489 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0665  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.64 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.482499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.56 
 
 		 498 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.67 
 
 		 491 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0105  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.71 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.314032  normal  0.119899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.24 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2272  hypothetical protein  32.29 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.64496  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.2 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38 
 
 		 482 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.46 
 
 		 498 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  36.67 
 
 		 491 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.56 
 
 		 531 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.13 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.56 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.96 
 
 		 490 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.07 
 
 		 522 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.71 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.7 
 
 		 499 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.07 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.56 
 
 		 535 aa  57  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39 
 
 		 424 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  34.04 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.36 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.7 
 
 		 522 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1359  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.54 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.78 
 
 		 500 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.97 
 
 		 520 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.73 
 
 		 424 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.67 
 
 		 423 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36 
 
 		 427 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.22 
 
 		 469 aa  53.9  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.34 
 
 		 490 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.97 
 
 		 529 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2599  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0534  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.68 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.63 
 
 		 518 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.77 
 
 		 519 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.38 
 
 		 423 aa  50.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.16 
 
 		 527 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.66 
 
 		 424 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.23 
 
 		 518 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.23 
 
 		 518 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.83 
 
 		 519 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1151  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor NifB/Y/X family protein  29.52 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.11 
 
 		 423 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.56 
 
 		 159 aa  43.5  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  25.84 
 
 		 243 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  31.13 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  30.3 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1397  nitrogenase iron-molybdenum cofactor maturation domain protein family  25 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0681076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  32.97 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.41 
 
 		 243 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0839  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.04 
 
 		 113 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.07 
 
 		 418 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.7 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  25.51 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  28.28 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.77 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.46 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  28.28 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1532  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  25.22 
 
 		 130 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000412529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>