77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3991 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  82.91 
 
 		 158 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  53.61 
 
 		 165 aa  180  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  57.49 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  53.8 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  53.19 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  53.47 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  48.73 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  42.96 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  39.72 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  39.72 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.9 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.34 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  38.3 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  42.55 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.73 
 
 		 155 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  41.46 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  44.72 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  40.8 
 
 		 131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  40.8 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  41.13 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  42.4 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  38.71 
 
 		 133 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  38.76 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  40 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.1 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  40.8 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  35.25 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  40.48 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  40.48 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  37.1 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.62 
 
 		 134 aa  94  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.96 
 
 		 127 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  33.33 
 
 		 243 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  35.51 
 
 		 132 aa  90.9  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.51 
 
 		 242 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  37.6 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.59 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.27 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  33.59 
 
 		 128 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  32.14 
 
 		 129 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.61 
 
 		 227 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  33.87 
 
 		 137 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  32.26 
 
 		 129 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  30.94 
 
 		 128 aa  84  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  30.08 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.68 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.09 
 
 		 247 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.86 
 
 		 247 aa  80.5  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.2 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  28.87 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.68 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  28.17 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.37 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.39 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.63 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.05 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  34.68 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  23.62 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.75 
 
 		 106 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  23.81 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.3 
 
 		 491 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  28.3 
 
 		 491 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  28.89 
 
 		 520 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.2 
 
 		 527 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.71 
 
 		 520 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.85 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.78 
 
 		 495 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.27 
 
 		 491 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.95 
 
 		 518 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.14 
 
 		 109 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.27 
 
 		 522 aa  41.2  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 		 503 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2080  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.51 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.46 
 
 		 518 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  24.56 
 
 		 120 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>