50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1151 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1151  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor NifB/Y/X family protein  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.35 
 
 		 424 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.11 
 
 		 423 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.98 
 
 		 423 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.86 
 
 		 423 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.59 
 
 		 423 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.1 
 
 		 420 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.66 
 
 		 424 aa  98.6  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  41.67 
 
 		 424 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.67 
 
 		 427 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  39.25 
 
 		 418 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0839  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.32 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.99 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0665  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.99 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.482499  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.96 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.61 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0105  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.99 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.314032  normal  0.119899 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 473 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.38 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2103  putative nitrogen fixation protein  33.66 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.38 
 
 		 484 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.89 
 
 		 475 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.79 
 
 		 482 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.62 
 
 		 655 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.98 
 
 		 495 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2080  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.52 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.07 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.01 
 
 		 489 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2272  hypothetical protein  29.27 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.64496  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.19 
 
 		 495 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  31.03 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.56 
 
 		 518 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.28 
 
 		 518 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.35 
 
 		 479 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3488  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.21 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.85 
 
 		 491 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.85 
 
 		 491 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30 
 
 		 464 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.41 
 
 		 483 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.91 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.16 
 
 		 527 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.82 
 
 		 499 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.44 
 
 		 519 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.02 
 
 		 518 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2599  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.23 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187403  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.82 
 
 		 522 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.45 
 
 		 468 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.76 
 
 		 531 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  30 
 
 		 520 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.53 
 
 		 144 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>