77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6221 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 		 165 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  57.23 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  53.61 
 
 		 163 aa  180  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  57.45 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.25 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  47.59 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  49.24 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  45.68 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  38.3 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  37.86 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  37.86 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  40.71 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.97 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  39.57 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.1 
 
 		 155 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  38.57 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  39.2 
 
 		 131 aa  111  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  37.14 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  33.81 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  39.52 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.81 
 
 		 135 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  33.81 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  35 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  34.29 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.87 
 
 		 127 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.88 
 
 		 247 aa  97.8  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  32.89 
 
 		 243 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  34.29 
 
 		 139 aa  95.5  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  31.85 
 
 		 128 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.2 
 
 		 137 aa  94.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  36.51 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  34.75 
 
 		 136 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.29 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  32.54 
 
 		 119 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  33.33 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  34.68 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  33.33 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  31.43 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  30.71 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  31.01 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  34.4 
 
 		 138 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  29.84 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  31.91 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.4 
 
 		 242 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  36.29 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.88 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.25 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.6 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.85 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.99 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.67 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  27.2 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.09 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  35.2 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.81 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.81 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.47 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.78 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.36 
 
 		 123 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  20.54 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.86 
 
 		 106 aa  52  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  21.38 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.91 
 
 		 109 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  31.03 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.1 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0105  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.91 
 
 		 106 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.314032  normal  0.119899 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0665  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.33 
 
 		 106 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.482499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2080  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.13 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  29.82 
 
 		 503 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.63 
 
 		 491 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  32.63 
 
 		 491 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2803  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  33.73 
 
 		 109 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.21 
 
 		 109 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.63 
 
 		 491 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.82 
 
 		 490 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.71 
 
 		 123 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0673  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.92 
 
 		 109 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.651625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>