More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0024 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  100 
 
 
309 aa  636    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  72.82 
 
 
310 aa  478  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  70 
 
 
325 aa  461  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  69.58 
 
 
310 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.16 
 
 
321 aa  288  7e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.49 
 
 
348 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  36.33 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.42 
 
 
308 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  37.55 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.79 
 
 
298 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.04 
 
 
308 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.8 
 
 
332 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
318 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.65 
 
 
336 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.57 
 
 
297 aa  152  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.45 
 
 
299 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.87 
 
 
298 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.46 
 
 
296 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.63 
 
 
291 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1581  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.95 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.58 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.9 
 
 
298 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.43 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.7 
 
 
329 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.55 
 
 
333 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.08 
 
 
319 aa  142  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.22 
 
 
326 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.19 
 
 
337 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.21 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.87 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.4 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.4 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.72 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.01 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.21 
 
 
336 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.4 
 
 
337 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.4 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.79 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.4 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.39 
 
 
330 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.25 
 
 
337 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.19 
 
 
322 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.65 
 
 
345 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.44 
 
 
340 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.86 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.69 
 
 
339 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.33 
 
 
362 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.44 
 
 
355 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 
345 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.34 
 
 
338 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.53 
 
 
326 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.08 
 
 
335 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.56 
 
 
350 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.52 
 
 
337 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.52 
 
 
337 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.52 
 
 
337 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1351  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.66 
 
 
340 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.13 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.03 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.51 
 
 
334 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.79 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.3 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.25 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.91 
 
 
345 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.21 
 
 
326 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.38 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.61 
 
 
373 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.91 
 
 
337 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.47 
 
 
319 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0729  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.35 
 
 
340 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000041068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.22 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.91 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.91 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.91 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.1 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0101  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.21 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.012034  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.27 
 
 
375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.22 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.97 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.62 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.28 
 
 
363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.62 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.95 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.61 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.03 
 
 
395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.72 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.3 
 
 
338 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.33 
 
 
333 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 
343 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.79 
 
 
343 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.2 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.25 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.35 
 
 
359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2435  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.84 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168492  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.62 
 
 
338 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>