70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1039 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0924  hypothetical protein  94.59 
 
 		 80 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000711091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0923  hypothetical protein  94.81 
 
 		 77 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000601668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.63 
 
 		 312 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.59 
 
 		 312 aa  99.4  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 310 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 314 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 303 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 364 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 303 aa  91.7  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 313 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  27.46 
 
 		 319 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 320 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 319 aa  88.6  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 329 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 330 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  21.84 
 
 		 326 aa  85.5  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.24 
 
 		 680 aa  83.6  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  20.42 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  27.98 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  22.71 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  27 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  19.7 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  27.66 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  20.52 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  25.56 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  19.77 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  16.86 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  31.18 
 
 		 279 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.81 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 343 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>