120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2416 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  100 
 
 
328 aa  680    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 
310 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  36.25 
 
 
320 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  35.99 
 
 
313 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 
331 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 
313 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 
319 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 
295 aa  206  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  37.58 
 
 
319 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.08 
 
 
680 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  35.8 
 
 
313 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 
316 aa  202  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  44.08 
 
 
312 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.99 
 
 
312 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 
310 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  41.83 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  37.01 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  45.67 
 
 
237 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  44.08 
 
 
239 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 
311 aa  178  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  51.9 
 
 
244 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 
364 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 
332 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
329 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  32.08 
 
 
326 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 
311 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 
311 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 
323 aa  153  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
365 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  35.81 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  32.41 
 
 
326 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 
319 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  36.28 
 
 
326 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  36.79 
 
 
266 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  35.27 
 
 
267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  36.54 
 
 
270 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  29.93 
 
 
310 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 
303 aa  136  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  30.26 
 
 
304 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 
303 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
300 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  29.38 
 
 
302 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
308 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.91 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  28.09 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  28.16 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.8 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  24.02 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 
292 aa  55.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
428 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.93 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 
354 aa  52.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.5 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  21.43 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2343  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.53 
 
 
383 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.19 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  22.88 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  22.58 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 
331 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.11 
 
 
323 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 
331 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 
574 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 
332 aa  47  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 
384 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 
368 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.33 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.92 
 
 
395 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  27.71 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 
543 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.85 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.17 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.99 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.47 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.03 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.03 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2276  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.6 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>