66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1760 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  637    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  51.12 
 
 		 319 aa  355  6.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  57.64 
 
 		 313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  54.34 
 
 		 323 aa  345  7e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  53.53 
 
 		 311 aa  341  8e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  51.08 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  54.87 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  44.69 
 
 		 311 aa  278  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  39.68 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.24 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  35.46 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.38 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  36.88 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  45.28 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  37.1 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  45.09 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  38.36 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  40.49 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  39.27 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  37.33 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 364 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  44.25 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  39.68 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.78 
 
 		 680 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  35.27 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  34.29 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  31.84 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  29.11 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 303 aa  95.9  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  20.52 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  28.24 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.12 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  31.06 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.25 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.97 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6404  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.12 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1425  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.12 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  27.27 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7063  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.34 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00651561  normal  0.935573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.25 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.71 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>