66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3462 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  63.64 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  59.81 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  53.87 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  57.64 
 
 		 323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  52.26 
 
 		 326 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  52.73 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  32.9 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  37.09 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.68 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  36.73 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  33.87 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.37 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  35.32 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.49 
 
 		 680 aa  145  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  34.85 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  36.75 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  35.32 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 		 237 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  35.02 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  33.76 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  32.28 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  33.65 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  36.42 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  30.14 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  29.3 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.29 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  24.77 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  25.7 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  20.18 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  20.18 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  24.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  27.04 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.92 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  31.34 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 426 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 364 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>