83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0688 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  100 
 
 		 312 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  75.56 
 
 		 311 aa  484  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  65.58 
 
 		 310 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  66.88 
 
 		 321 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  66.88 
 
 		 312 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  59.94 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  57.69 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  47.25 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  46.28 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.42 
 
 		 680 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  43.72 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  40.09 
 
 		 239 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  41.96 
 
 		 319 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  36.29 
 
 		 237 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  40.27 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  32.48 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  29.84 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  45.91 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  37.28 
 
 		 365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  32.77 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  35.34 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  39.51 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  34.11 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  37.07 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  33.03 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  34.1 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  26.63 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  31.3 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.56 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.22 
 
 		 351 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.49 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1165  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.96 
 
 		 372 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.07 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  25.43 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.68 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  26.28 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.13 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.71 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  28.23 
 
 		 464 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.95 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.5 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.97 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 202 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 365 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.96 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  21.52 
 
 		 371 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  25.36 
 
 		 377 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  26.67 
 
 		 364 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.82 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.67 
 
 		 373 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>