106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11060 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  59.24 
 
 		 310 aa  310  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  51.93 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  50.42 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  50.44 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  47.16 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  45.34 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  47.87 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  38.39 
 
 		 364 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.41 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  39.08 
 
 		 320 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  39.57 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  38.56 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 316 aa  188  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  40.09 
 
 		 312 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 		 365 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  37.66 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.39 
 
 		 680 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  40.09 
 
 		 321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  44.08 
 
 		 328 aa  181  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  40.47 
 
 		 313 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  47.5 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  39.41 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  35.74 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  38.59 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  37.76 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 311 aa  151  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  36.16 
 
 		 304 aa  148  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  35.22 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 300 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 300 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  32.53 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 319 aa  139  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  36.36 
 
 		 310 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  36.41 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  36.23 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  28.24 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  29.41 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 461 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 359 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.07 
 
 		 366 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.77 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1444  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.06 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000773011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 		 347 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  26.53 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  21.9 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4751  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.97 
 
 		 356 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  35.38 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.4 
 
 		 374 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 450 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  29.17 
 
 		 311 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.6 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.92 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  26.06 
 
 		 347 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.35 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.23 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3862  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 613 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.2 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.5 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.5 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.59 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 437 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  20.74 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 337 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10886  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.83 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6033000000000002e-27  normal  0.157958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.5 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.86 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.23 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 365 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.23 
 
 		 373 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  27.34 
 
 		 454 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.67 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.14 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.02 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 341 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>