64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0562 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  56.59 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  53.87 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  53.53 
 
 		 323 aa  341  8e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  52.1 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  50.49 
 
 		 326 aa  332  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  52.1 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 		 311 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.82 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  34.32 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  38.59 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.87 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  35.69 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  40.85 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  34.19 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  39.07 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  41.35 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  36.55 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  36.79 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.39 
 
 		 680 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 329 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  44.59 
 
 		 244 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 		 364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  31.58 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  29.52 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  22.78 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 231 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  27.35 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  28.85 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.61 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  22.94 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  27.17 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.22 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  24.51 
 
 		 786 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  21.5 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.04 
 
 		 355 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>