97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1460 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 312 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  68.73 
 
 		 321 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  70.13 
 
 		 311 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  66.88 
 
 		 312 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  68.4 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  65.58 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  64.61 
 
 		 314 aa  411  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  50.16 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  48.73 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.53 
 
 		 680 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  39.4 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  42.79 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  41.82 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  39.41 
 
 		 239 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  32.48 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  36.66 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  38.37 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 237 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  37.66 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  38.94 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  31.35 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  39.82 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  31.06 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  48.43 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  41.46 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  36.19 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  27.78 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  37.98 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  36.1 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  33.49 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  28.17 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 231 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  27.22 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  31.11 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1204  radical SAM enzyme, Cfr family  23.04 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110623 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.88 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.53 
 
 		 355 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  23.77 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.94 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.4 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  29.2 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  23.81 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  23.58 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.82 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.36 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.45 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  26.83 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  25.98 
 
 		 431 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  27.31 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1567  hypothetical protein  24.06 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00430195  hitchhiker  0.00703244 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  26.83 
 
 		 425 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.35 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.21 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 200 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.18 
 
 		 372 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3819  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.89 
 
 		 509 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3513  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.89 
 
 		 509 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3806  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.89 
 
 		 509 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.89 
 
 		 509 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  24.4 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3784  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.89 
 
 		 509 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0126107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3621  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.89 
 
 		 509 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.55 
 
 		 351 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3908  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.89 
 
 		 509 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  25.79 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>