170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1270 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  47.42 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  47.42 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  46.74 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  47.75 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  44.03 
 
 		 304 aa  248  8e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  43.88 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 		 308 aa  236  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  40.38 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  35.66 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.36 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.13 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 		 328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  30.42 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.04 
 
 		 680 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  29.89 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  29.88 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  28.81 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  30.34 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  33.13 
 
 		 244 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 323 aa  95.5  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 266 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  23.24 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.3 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 461 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 533 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 574 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  26.23 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  28.12 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  28.46 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  24.54 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  21.12 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.49 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.25 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.32 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.14 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  25.99 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  25 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.49 
 
 		 514 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 514 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 514 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.22 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.86 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  21.15 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.17 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.24 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.27 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.66 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.22 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.79 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.99 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 362 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  24.12 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  19.91 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0740  Fe-S oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  22.47 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3837  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1068  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.94 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0439082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0630  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.94 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.94 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>