49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2571 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  732    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  57.48 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  57.46 
 
 		 267 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  53.74 
 
 		 292 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  52.67 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  35.66 
 
 		 291 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  27.5 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.07 
 
 		 680 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  33.53 
 
 		 244 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  29.38 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 295 aa  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 300 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  30 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  29.69 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  24.24 
 
 		 310 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 311 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 319 aa  46.2  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  30.26 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  45.24 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.17 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  48.65 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 312 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  51.35 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.83 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  28.41 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 239 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>