69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1559 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  100 
 
 
316 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  77.32 
 
 
314 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  65.58 
 
 
312 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  62.78 
 
 
321 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  62.7 
 
 
310 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  64.1 
 
 
311 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  59.94 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  44.37 
 
 
331 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.4 
 
 
680 aa  245  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  39.56 
 
 
312 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  36.42 
 
 
313 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 
328 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 
310 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  43.17 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  37.15 
 
 
308 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  42.17 
 
 
295 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 
239 aa  188  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 
313 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  44.81 
 
 
313 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  41.94 
 
 
319 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 
311 aa  176  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 
313 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  40 
 
 
237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  31.75 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  33.75 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  34.06 
 
 
332 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 
364 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  35.46 
 
 
323 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 
300 aa  155  7e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 
329 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  49.06 
 
 
244 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  36.4 
 
 
365 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  29.5 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  40 
 
 
267 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  32.88 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
266 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  34.95 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  34.63 
 
 
270 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 
300 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  33.01 
 
 
310 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  32.52 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 
231 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.6 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  26.26 
 
 
369 aa  53.1  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  23.68 
 
 
373 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  24.11 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  24.82 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
338 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  24.5 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.67 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.29 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 
365 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 
461 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.12 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>