84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1848 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  634    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  72.9 
 
 
321 aa  484  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  65.58 
 
 
312 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.4 
 
 
312 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  66.88 
 
 
311 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  62.7 
 
 
316 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  62.06 
 
 
314 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  48.87 
 
 
320 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  48.54 
 
 
331 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.19 
 
 
680 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  37.94 
 
 
310 aa  212  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  45.83 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 
328 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 
308 aa  188  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 
311 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
313 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 
239 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  36.48 
 
 
295 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 
323 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  37.94 
 
 
319 aa  185  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  38.13 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  32.06 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  52.83 
 
 
244 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 
319 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 
313 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 
364 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
329 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  35.22 
 
 
237 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  39.72 
 
 
332 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 
365 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  31.06 
 
 
326 aa  148  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 
300 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  40.49 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  31.56 
 
 
326 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 
300 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  33.49 
 
 
310 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  31.01 
 
 
302 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
300 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  35.61 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  33.49 
 
 
303 aa  119  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  32.04 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 
231 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  26.06 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 
461 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  31.78 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  31.74 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 
197 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  27.94 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.59 
 
 
369 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4222  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.92 
 
 
370 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1068  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 
370 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0439082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0630  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 
370 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 
370 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0989  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 
370 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197702  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.31 
 
 
370 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.08 
 
 
369 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1815  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.36 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2194  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734508  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2864  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.36 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2803  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.36 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000449435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.36 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00347388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2492  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.36 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0107198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0519  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.36 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.88 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.7 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.37 
 
 
370 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1204  radical SAM enzyme, Cfr family  23.26 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110623 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  51.35 
 
 
365 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  24.19 
 
 
373 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.36 
 
 
370 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.95 
 
 
359 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>