76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2341 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 330 aa  677    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  53.35 
 
 		 319 aa  323  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  52.06 
 
 		 313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  46.77 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  50.42 
 
 		 239 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.67 
 
 		 680 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  40.33 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  38.93 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  35.74 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  43.17 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  38.13 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  38.57 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 310 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.37 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  37.45 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 303 aa  173  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 		 237 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  31.06 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  35.56 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  33.01 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  33.55 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  33.21 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  35.04 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  36.79 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  41.95 
 
 		 244 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  37.86 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  22.88 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  33.58 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  26.55 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  23.5 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.48 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.12 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0404  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.79 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  26.96 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  22.12 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 450 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 434 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.09 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.45 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>