More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0512 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1002    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  60.92 
 
 
287 aa  354  2e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  65.52 
 
 
287 aa  349  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  60.07 
 
 
287 aa  345  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  59.72 
 
 
287 aa  345  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  35.86 
 
 
516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  36.32 
 
 
545 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 
537 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  42.97 
 
 
519 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 
512 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  35.59 
 
 
524 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  38.82 
 
 
562 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  40.6 
 
 
538 aa  93.2  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
565 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  36.5 
 
 
538 aa  91.3  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1115  extracellular solute-binding protein family 5  42.11 
 
 
596 aa  87  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  39.57 
 
 
576 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 
517 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.25 
 
 
524 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
588 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  26.56 
 
 
532 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.88 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  38.46 
 
 
546 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  40.71 
 
 
593 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.48 
 
 
530 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  39.82 
 
 
592 aa  75.9  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.87 
 
 
525 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  36.88 
 
 
866 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  34.38 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  34.38 
 
 
579 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
604 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.81 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.61 
 
 
505 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  30.22 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
540 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  35.96 
 
 
581 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.81 
 
 
587 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  28.8 
 
 
587 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.51 
 
 
524 aa  73.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  27.51 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.51 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.47 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  34.39 
 
 
547 aa  73.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.27 
 
 
526 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.22 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.47 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  30.22 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  27.51 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  37.01 
 
 
544 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  34.11 
 
 
557 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  30.22 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.51 
 
 
524 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.14 
 
 
544 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1850  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  38.85 
 
 
563 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
657 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0020  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  28.33 
 
 
539 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.31 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 
657 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  37.04 
 
 
621 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 
507 aa  71.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 
554 aa  70.5  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  35.65 
 
 
580 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  35.65 
 
 
580 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  30.6 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.65 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
531 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
544 aa  69.7  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  33.08 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
506 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.72 
 
 
540 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
538 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2277  extracellular solute-binding protein family 5  32.59 
 
 
615 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00527261  decreased coverage  0.000000000210766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  32.1 
 
 
521 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
559 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
539 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.39 
 
 
592 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  40.18 
 
 
617 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  40.35 
 
 
591 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.84 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.84 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.84 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
549 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.84 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.63 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  32.84 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
590 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.09 
 
 
593 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  34.23 
 
 
584 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.9 
 
 
513 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.83 
 
 
523 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
500 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  40.35 
 
 
622 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  29.68 
 
 
552 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
639 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 
591 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 
636 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.1 
 
 
532 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>