More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2944 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
587 aa  1182    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 
604 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  48.07 
 
 
605 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
590 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
639 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 
617 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.35 
 
 
540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
580 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
580 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
588 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
581 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
541 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2361  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.85 
 
 
445 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0243915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
526 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
540 aa  143  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1058  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.46 
 
 
653 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 
576 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
539 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0413  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.08 
 
 
653 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3294  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 
533 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
538 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.14 
 
 
538 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.1 
 
 
546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 
534 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
586 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 
532 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 
554 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
591 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 
531 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 
593 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.69 
 
 
527 aa  126  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.69 
 
 
527 aa  126  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.6 
 
 
556 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
556 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
622 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 
621 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  28.26 
 
 
562 aa  124  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.27 
 
 
525 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
559 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
532 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  27.67 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2770  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.14158  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.61 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 
537 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.07 
 
 
524 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
591 aa  117  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
508 aa  117  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2277  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 
615 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00527261  decreased coverage  0.000000000210766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 
549 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 
584 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
553 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.64 
 
 
597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.46 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
615 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.25 
 
 
593 aa  111  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
562 aa  111  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
565 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 
563 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
566 aa  110  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
537 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3874  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.57 
 
 
585 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.62 
 
 
593 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.45 
 
 
511 aa  109  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 
580 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
629 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 
628 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.22 
 
 
525 aa  108  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 
547 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.28 
 
 
593 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.28 
 
 
593 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.28 
 
 
593 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  21.99 
 
 
517 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 
557 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 
522 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.11 
 
 
498 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
527 aa  107  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.57 
 
 
592 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26 
 
 
524 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 
566 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  25.82 
 
 
532 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 
526 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
547 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
556 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  24.01 
 
 
510 aa  104  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.89 
 
 
524 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.32 
 
 
543 aa  104  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
543 aa  104  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.57 
 
 
534 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
544 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  24.17 
 
 
545 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  26.47 
 
 
532 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  23.34 
 
 
580 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
570 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.71 
 
 
527 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
521 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>