More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1116 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 592 aa  1202    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1115  extracellular solute-binding protein family 5  63.87 
 
 		 596 aa  761    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  38.94 
 
 		 593 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 		 591 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.65 
 
 		 592 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 591 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.02 
 
 		 593 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.84 
 
 		 593 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.86 
 
 		 593 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.93 
 
 		 593 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.93 
 
 		 593 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.93 
 
 		 593 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  33.22 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0778  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  32.92 
 
 		 605 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000335108  hitchhiker  0.00000000000176984 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1615  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  32.91 
 
 		 596 aa  294  4e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176956  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2026  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  31.77 
 
 		 600 aa  266  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00409621  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D17  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  31.6 
 
 		 600 aa  265  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0728  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  30.19 
 
 		 591 aa  265  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.414053 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1666  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  32.59 
 
 		 467 aa  262  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 571 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 571 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 557 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  29.19 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  29.08 
 
 		 579 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.24 
 
 		 575 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.32 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.29 
 
 		 559 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.3 
 
 		 575 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 573 aa  150  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.3 
 
 		 575 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 567 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.15 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  26.15 
 
 		 566 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 572 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.27 
 
 		 575 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  26.61 
 
 		 575 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 575 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 575 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  27.03 
 
 		 575 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 575 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.53 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 593 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 551 aa  123  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  33.33 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.39 
 
 		 538 aa  114  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 565 aa  114  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.31 
 
 		 545 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 576 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.78 
 
 		 589 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 540 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.27 
 
 		 546 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 533 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.11 
 
 		 516 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 534 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 628 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  25.51 
 
 		 530 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 507 aa  107  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  24.6 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.43 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 		 584 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 595 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.9 
 
 		 588 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  22.85 
 
 		 607 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  22.85 
 
 		 607 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 604 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  23.77 
 
 		 510 aa  102  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.46 
 
 		 547 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 513 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 588 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 538 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 535 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 579 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 531 aa  100  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 563 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 535 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 537 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.71 
 
 		 527 aa  98.2  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 542 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 579 aa  97.4  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 617 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.39 
 
 		 565 aa  97.4  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 595 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.04 
 
 		 527 aa  97.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.04 
 
 		 527 aa  97.1  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 591 aa  97.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 543 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 532 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 		 622 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>