More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4719 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  56.05 
 
 
595 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  54.33 
 
 
594 aa  667    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  54.77 
 
 
587 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
591 aa  1210    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  53.3 
 
 
584 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  51.72 
 
 
607 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  51.55 
 
 
607 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  45.69 
 
 
587 aa  538  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  37.01 
 
 
580 aa  360  3e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 
578 aa  354  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 
579 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
578 aa  326  9e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
579 aa  324  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  34.3 
 
 
581 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 
587 aa  260  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 
577 aa  250  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 
577 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 
589 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
589 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
638 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
584 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
573 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
578 aa  210  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.43 
 
 
538 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
551 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
538 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
540 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 
557 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
565 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
533 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 
567 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
539 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.38 
 
 
540 aa  160  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 
622 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  27.12 
 
 
566 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
512 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 
576 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
559 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.92 
 
 
567 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.01 
 
 
546 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
502 aa  153  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
516 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
619 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
664 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 
532 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
657 aa  146  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
657 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  22.56 
 
 
515 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
544 aa  143  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 
534 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
534 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
655 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  30.46 
 
 
765 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
591 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
645 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  24.45 
 
 
509 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
505 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.15 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.56 
 
 
580 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.56 
 
 
579 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.81 
 
 
593 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 
645 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
575 aa  136  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.76 
 
 
593 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.76 
 
 
593 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.76 
 
 
593 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.02 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.15 
 
 
593 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 
592 aa  135  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1925  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.82 
 
 
544 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.35 
 
 
593 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
508 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 
593 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
618 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.24 
 
 
541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1345  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  26.82 
 
 
544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 
563 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.85 
 
 
524 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
526 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
512 aa  134  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 
575 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
516 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
658 aa  133  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
655 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4721  periplasmic oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  64.58 
 
 
96 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.27 
 
 
633 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 
631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
643 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
537 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
658 aa  131  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1376  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  26.61 
 
 
544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.268389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.51 
 
 
516 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 
505 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>