More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1660 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 589 aa  1195    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  80.98 
 
 		 589 aa  997    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  49.1 
 
 		 573 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  47.83 
 
 		 578 aa  501  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  49.34 
 
 		 584 aa  497  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 579 aa  227  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 591 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 607 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 577 aa  220  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 578 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 607 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  28.57 
 
 		 587 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 578 aa  213  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 584 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 587 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 595 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 594 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 638 aa  179  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 640 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 655 aa  154  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.22 
 
 		 633 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 638 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 664 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 645 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 629 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.63 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 533 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 534 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 657 aa  146  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 655 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 657 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.72 
 
 		 540 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 538 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 551 aa  143  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.04 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.7 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.25 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  25.2 
 
 		 566 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.79 
 
 		 546 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 686 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 567 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 559 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 693 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 539 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 656 aa  137  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 600 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 593 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 565 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 544 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 528 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.85 
 
 		 531 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 		 729 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.54 
 
 		 589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 765 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 658 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 728 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 658 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.69 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 544 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 659 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 542 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 727 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 643 aa  126  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 735 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 		 651 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  26.95 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 735 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 642 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 622 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.18 
 
 		 542 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 695 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 544 aa  125  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 696 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 757 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  26.67 
 
 		 605 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.7 
 
 		 560 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 536 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  26.53 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>