More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0309 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  60.08 
 
 		 735 aa  923    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  57.99 
 
 		 729 aa  883    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 765 aa  1580    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  65.04 
 
 		 659 aa  932    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  51.97 
 
 		 757 aa  707    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  62.86 
 
 		 656 aa  890    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  49.03 
 
 		 735 aa  714    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  52.32 
 
 		 727 aa  706    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  52.54 
 
 		 728 aa  703    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 664 aa  300  7e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 		 638 aa  296  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 		 640 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 655 aa  290  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 643 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 658 aa  269  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 655 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 642 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 658 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 657 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 645 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 657 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 682 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.01 
 
 		 638 aa  227  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.68 
 
 		 633 aa  227  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  28.55 
 
 		 641 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 651 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 635 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 639 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 635 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 633 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 		 664 aa  194  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.82 
 
 		 671 aa  183  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.44 
 
 		 626 aa  181  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.25 
 
 		 679 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 580 aa  165  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 655 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 645 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 695 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 607 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 595 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 		 607 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 594 aa  141  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 591 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 		 696 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 693 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 578 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 584 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  26.3 
 
 		 587 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  29.76 
 
 		 695 aa  131  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 589 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 589 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 578 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  32.36 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 573 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 579 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 581 aa  110  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 587 aa  110  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 578 aa  108  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 		 577 aa  104  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 544 aa  104  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 544 aa  100  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.54 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.16 
 
 		 524 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.88 
 
 		 520 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 577 aa  95.9  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 508 aa  95.5  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 529 aa  94.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 524 aa  94  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 544 aa  93.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 		 529 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 528 aa  92  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 536 aa  91.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 629 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 535 aa  91.3  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.64 
 
 		 539 aa  90.9  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.05 
 
 		 526 aa  90.9  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 534 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 535 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.28 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.67 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.42 
 
 		 538 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.87 
 
 		 526 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 529 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.87 
 
 		 526 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.87 
 
 		 526 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.34 
 
 		 532 aa  89  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.87 
 
 		 526 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25 
 
 		 541 aa  87.8  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.69 
 
 		 527 aa  87.8  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 516 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.53 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>