More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2454 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 682 aa  1400    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 664 aa  395  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 655 aa  395  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  38.45 
 
 		 640 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 		 655 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  37.4 
 
 		 638 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 658 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 657 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 657 aa  362  9e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 643 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  34.91 
 
 		 645 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  34.92 
 
 		 645 aa  324  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.33 
 
 		 633 aa  321  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.33 
 
 		 638 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 686 aa  274  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 		 651 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  30.09 
 
 		 765 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 642 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 641 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 		 635 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.12 
 
 		 626 aa  241  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 757 aa  238  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 		 659 aa  237  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 735 aa  237  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 635 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.56 
 
 		 671 aa  234  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 735 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 639 aa  232  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 656 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 727 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 728 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  30.38 
 
 		 645 aa  211  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  30.8 
 
 		 679 aa  210  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 		 664 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 643 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 655 aa  157  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 		 696 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 695 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 580 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  28.17 
 
 		 695 aa  140  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 693 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 		 584 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 594 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 591 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 		 607 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 607 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 573 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 578 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 589 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 578 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 595 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.17 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 589 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 584 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 587 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 528 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  26.54 
 
 		 605 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.93 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 581 aa  102  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  26.18 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 587 aa  101  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 578 aa  101  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 557 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.48 
 
 		 532 aa  98.6  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 579 aa  97.8  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.85 
 
 		 545 aa  96.3  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.75 
 
 		 520 aa  92.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 492 aa  90.9  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 		 532 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.36 
 
 		 492 aa  88.2  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.36 
 
 		 479 aa  88.2  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 538 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 532 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  24.42 
 
 		 560 aa  87.4  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  22.9 
 
 		 645 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 		 545 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 526 aa  86.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 627 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 524 aa  85.9  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.82 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 		 631 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.33 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.33 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.69 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  23.97 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>