More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1805 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  75.95 
 
 		 656 aa  1058    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  56.61 
 
 		 727 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  65.04 
 
 		 765 aa  932    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  53.65 
 
 		 735 aa  711    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  61.74 
 
 		 735 aa  865    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  57.95 
 
 		 729 aa  790    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  56.46 
 
 		 728 aa  757    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 659 aa  1368    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  53.12 
 
 		 757 aa  706    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  31.6 
 
 		 638 aa  301  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 655 aa  298  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 		 640 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 		 664 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 655 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 658 aa  259  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 658 aa  259  9e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 		 643 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 657 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 657 aa  243  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 682 aa  237  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  34.43 
 
 		 645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.12 
 
 		 633 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  34.57 
 
 		 645 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  29.7 
 
 		 651 aa  233  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 642 aa  229  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 635 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 635 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 633 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.41 
 
 		 638 aa  204  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 643 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 		 664 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 639 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.01 
 
 		 671 aa  196  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 641 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  26.88 
 
 		 686 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.2 
 
 		 626 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 655 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 645 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.56 
 
 		 679 aa  164  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 693 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 		 695 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 696 aa  138  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  30.7 
 
 		 695 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 		 580 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 589 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 607 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 595 aa  117  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 584 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 594 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 584 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 591 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 573 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.53 
 
 		 587 aa  104  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 578 aa  103  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 		 578 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 		 548 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 548 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 577 aa  96.3  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 579 aa  95.9  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 579 aa  95.5  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 		 577 aa  94.7  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 587 aa  94  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 524 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.53 
 
 		 588 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 581 aa  90.1  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 596 aa  87.4  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 559 aa  87  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.69 
 
 		 540 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 591 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.14 
 
 		 524 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.2 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.68 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.37 
 
 		 562 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 597 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.94 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 551 aa  80.9  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  21.95 
 
 		 520 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  23.63 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 638 aa  78.2  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.82 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 631 aa  77.4  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 536 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>