More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4483 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 686 aa  1405    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 		 664 aa  350  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 		 640 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  33.28 
 
 		 638 aa  339  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 655 aa  334  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 643 aa  320  6e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  31.92 
 
 		 645 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 658 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  31.41 
 
 		 645 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.54 
 
 		 633 aa  306  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 657 aa  299  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 657 aa  291  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  33.75 
 
 		 651 aa  280  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 682 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.55 
 
 		 679 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.24 
 
 		 638 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 642 aa  250  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.74 
 
 		 671 aa  241  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 641 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 664 aa  235  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 633 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 		 635 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 635 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 639 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.94 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 643 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 		 729 aa  200  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 659 aa  197  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 656 aa  197  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 765 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 655 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 		 735 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 757 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 735 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 693 aa  160  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 728 aa  150  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  24.7 
 
 		 696 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  24.47 
 
 		 695 aa  147  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 695 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 		 589 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 587 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 584 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 591 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 577 aa  111  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 573 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 578 aa  107  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 577 aa  107  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 584 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 579 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.69 
 
 		 607 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 578 aa  99  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 594 aa  98.2  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 638 aa  97.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 607 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 587 aa  90.5  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.3 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  20.47 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.86 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 604 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  23.01 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  23.01 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  43.28 
 
 		 627 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.38 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.14 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  22.75 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 596 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 549 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.99 
 
 		 593 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.99 
 
 		 593 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.99 
 
 		 593 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 		 525 aa  62  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.95 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 621 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>