More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7124 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  56.89 
 
 		 626 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  61.04 
 
 		 633 aa  837    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 635 aa  1306    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  94.65 
 
 		 635 aa  1252    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  50.08 
 
 		 664 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  48.63 
 
 		 643 aa  568  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  45.89 
 
 		 639 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  43.36 
 
 		 655 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 638 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 655 aa  309  9e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 		 664 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  33.39 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 655 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 657 aa  283  9e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.71 
 
 		 633 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 658 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 658 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 657 aa  266  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 643 aa  262  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  31.41 
 
 		 645 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  30.78 
 
 		 645 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 682 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 735 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 		 686 aa  223  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.25 
 
 		 671 aa  223  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.62 
 
 		 638 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 656 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 651 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 659 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 642 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 		 641 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 729 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.55 
 
 		 679 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 735 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 757 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 645 aa  180  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 728 aa  177  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  23.69 
 
 		 695 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 693 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 696 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 573 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 578 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  26.12 
 
 		 695 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 584 aa  109  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 589 aa  107  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 607 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 587 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 591 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 578 aa  99.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 		 607 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 578 aa  98.2  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 587 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 591 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.2 
 
 		 592 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 638 aa  93.6  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 591 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 580 aa  93.2  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  25.62 
 
 		 587 aa  91.3  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 594 aa  90.5  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.25 
 
 		 531 aa  90.5  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 584 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.83 
 
 		 593 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.35 
 
 		 593 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 		 627 aa  87.8  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 595 aa  87.8  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  27.87 
 
 		 495 aa  87.4  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  23.74 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.69 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 579 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  24.7 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.51 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 596 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 575 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.32 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2277  extracellular solute-binding protein family 5  21.91 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00527261  decreased coverage  0.000000000210766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.91 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.91 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 575 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.65 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.91 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.39 
 
 		 575 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>