More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0595 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 645 aa  1320    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 		 638 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 640 aa  297  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 657 aa  286  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 664 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 655 aa  279  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  34.37 
 
 		 657 aa  276  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 651 aa  270  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 		 641 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.24 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 645 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 		 645 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.6 
 
 		 638 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.98 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 655 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 642 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 682 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 643 aa  228  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 639 aa  228  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  30.05 
 
 		 686 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 		 635 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 635 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 		 664 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 633 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 643 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.63 
 
 		 626 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 757 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 		 659 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 735 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 735 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 729 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 765 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.26 
 
 		 679 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 728 aa  170  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 727 aa  167  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 655 aa  157  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 		 573 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 695 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 589 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 578 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  24.92 
 
 		 695 aa  107  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 607 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  22.76 
 
 		 696 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 693 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 595 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 594 aa  104  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 578 aa  102  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 587 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  25.95 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 580 aa  98.6  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.99 
 
 		 588 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 591 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 587 aa  91.3  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 579 aa  88.2  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 579 aa  87.8  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 578 aa  85.9  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.67 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 		 619 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.71 
 
 		 538 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.21 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.21 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.41 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.21 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.21 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.26 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 567 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.19 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.45 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.61 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.64 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.02 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.21 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.21 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  20.62 
 
 		 591 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.3 
 
 		 532 aa  77  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 		 537 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.55 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.36 
 
 		 592 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.57 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>