More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6877 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  74.35 
 
 		 693 aa  1116    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 695 aa  1436    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  75.14 
 
 		 695 aa  1095    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  94.96 
 
 		 696 aa  1373    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 657 aa  166  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 657 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 655 aa  163  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 638 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 640 aa  157  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 643 aa  154  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 655 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 645 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 658 aa  151  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 729 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 645 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 658 aa  150  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 664 aa  150  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 651 aa  147  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 		 765 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 579 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  23.54 
 
 		 686 aa  144  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 635 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 633 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 656 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  23.69 
 
 		 635 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 		 659 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 682 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.64 
 
 		 633 aa  134  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 735 aa  132  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 642 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 578 aa  130  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 757 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.68 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 589 aa  125  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 589 aa  124  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.47 
 
 		 626 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.32 
 
 		 671 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 607 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 580 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 607 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 728 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.64 
 
 		 638 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 578 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 641 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  23.47 
 
 		 664 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 639 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 645 aa  107  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 584 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 643 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 587 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 		 587 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  24.87 
 
 		 577 aa  96.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 594 aa  96.3  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  26.43 
 
 		 538 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 595 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.8 
 
 		 556 aa  94  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 587 aa  90.5  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 591 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  22.76 
 
 		 577 aa  88.6  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 534 aa  87.8  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 581 aa  87.4  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  24.04 
 
 		 560 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  24.44 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 535 aa  85.1  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 618 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.4 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  21.61 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 536 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  25.21 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 		 547 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 549 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 525 aa  76.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.73 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3696  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.28 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>