More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1182 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
581 aa  1172    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  48.7 
 
 
580 aa  559  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 
579 aa  341  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  36.56 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 
579 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  37.64 
 
 
584 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  38.33 
 
 
607 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  37.95 
 
 
607 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
595 aa  326  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 
594 aa  316  9e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  35.12 
 
 
587 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 
578 aa  293  8e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
578 aa  287  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
591 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  32.18 
 
 
577 aa  259  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 
577 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  35.18 
 
 
587 aa  249  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 
573 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
584 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
578 aa  194  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
589 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 
589 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.6 
 
 
540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 
533 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
534 aa  181  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
538 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.08 
 
 
538 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
539 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
526 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.91 
 
 
546 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
551 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 
576 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.71 
 
 
524 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
565 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 
563 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.75 
 
 
539 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
638 aa  144  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.73 
 
 
511 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.01 
 
 
511 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
522 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  23.2 
 
 
531 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
508 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 
509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
575 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.47 
 
 
511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 
528 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
559 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.91 
 
 
567 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
536 aa  136  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 
575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.66 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.91 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.9 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 
544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
567 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  23.56 
 
 
573 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
522 aa  134  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.11 
 
 
575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
595 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.02 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
655 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 
512 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.78 
 
 
520 aa  130  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  24.2 
 
 
509 aa  130  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  26.32 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  26.32 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  24.67 
 
 
534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  22.43 
 
 
557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.42 
 
 
520 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
544 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.99 
 
 
575 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 
554 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
593 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.99 
 
 
575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.79 
 
 
555 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
564 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.79 
 
 
575 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
529 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
556 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.15 
 
 
542 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  23 
 
 
619 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.14 
 
 
535 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
544 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
618 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 
534 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.14 
 
 
559 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.45 
 
 
532 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  27.3 
 
 
516 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
498 aa  123  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
534 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  26.25 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  23.97 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 
540 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>