More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1352 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  87.83 
 
 		 535 aa  971    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 534 aa  1094    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  53.45 
 
 		 524 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  43.41 
 
 		 565 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  43.22 
 
 		 541 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  41.48 
 
 		 530 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  42.97 
 
 		 525 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  40.43 
 
 		 528 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  41.29 
 
 		 529 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  40.63 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  40.31 
 
 		 535 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  40.43 
 
 		 535 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  40.67 
 
 		 535 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  40.27 
 
 		 538 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  40.59 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  40.59 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  40.59 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.59 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.59 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.59 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  40.59 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.78 
 
 		 535 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 535 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.49 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.51 
 
 		 526 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  40.16 
 
 		 533 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  38.49 
 
 		 530 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  39.07 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  38.57 
 
 		 542 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  37.21 
 
 		 542 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  37.02 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.31 
 
 		 526 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.31 
 
 		 526 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.31 
 
 		 526 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  39.96 
 
 		 533 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.31 
 
 		 526 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  39.76 
 
 		 537 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.18 
 
 		 542 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  39.53 
 
 		 546 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  39.15 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  39.11 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  39.49 
 
 		 535 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 532 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  39.49 
 
 		 535 aa  360  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  39.49 
 
 		 535 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 544 aa  359  8e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  39.1 
 
 		 535 aa  359  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  38.98 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  39.11 
 
 		 532 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 		 545 aa  353  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 		 532 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 542 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 542 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 542 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 531 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 542 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 		 542 aa  346  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  35.45 
 
 		 532 aa  346  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  36.41 
 
 		 542 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.76 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  37.57 
 
 		 540 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 541 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.78 
 
 		 542 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 542 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  37.84 
 
 		 531 aa  340  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 541 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  34.57 
 
 		 589 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.79 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  37.79 
 
 		 542 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  37.79 
 
 		 542 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 542 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.23 
 
 		 542 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  38.46 
 
 		 520 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  37.03 
 
 		 526 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.4 
 
 		 542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.4 
 
 		 542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.4 
 
 		 536 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 532 aa  337  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  37.4 
 
 		 542 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 553 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 530 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 531 aa  336  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  36.81 
 
 		 506 aa  335  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  36.38 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 530 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 530 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  36.63 
 
 		 544 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.49 
 
 		 530 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  36.58 
 
 		 531 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  37.43 
 
 		 532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>