More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1807 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 528 aa  1082    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  59.01 
 
 		 534 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  55.53 
 
 		 532 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  57.94 
 
 		 520 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.87 
 
 		 534 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.51 
 
 		 539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  55.32 
 
 		 534 aa  589  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  54.17 
 
 		 524 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  54.46 
 
 		 542 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  50.1 
 
 		 544 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  50.88 
 
 		 527 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.55 
 
 		 529 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  48.08 
 
 		 531 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  46.41 
 
 		 544 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.63 
 
 		 531 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  47.64 
 
 		 544 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  45.76 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  45.4 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  44.23 
 
 		 560 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  43.86 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  41.51 
 
 		 558 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  43.85 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  36.35 
 
 		 529 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  37.82 
 
 		 515 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 516 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 536 aa  332  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  34.92 
 
 		 535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 537 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  38.9 
 
 		 537 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 534 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  35.53 
 
 		 516 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 		 528 aa  319  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  35.31 
 
 		 533 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  38.02 
 
 		 536 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  35.96 
 
 		 522 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  35.13 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 		 517 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 535 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  36.82 
 
 		 530 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 		 530 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  37.68 
 
 		 533 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  34.02 
 
 		 533 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 		 531 aa  286  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  35.6 
 
 		 534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  33.84 
 
 		 535 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  32.95 
 
 		 538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 538 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  32.58 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  46.03 
 
 		 259 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.81 
 
 		 538 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.87 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  31.95 
 
 		 534 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  31.64 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.93 
 
 		 511 aa  196  9e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 501 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 551 aa  193  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 539 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.13 
 
 		 535 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  29.66 
 
 		 563 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 		 495 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.07 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.53 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 499 aa  186  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.85 
 
 		 541 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.13 
 
 		 511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 494 aa  184  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 526 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.1 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.14 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.35 
 
 		 510 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.55 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.35 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.35 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.35 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 502 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 576 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 544 aa  169  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>