More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2569 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 558 aa  1136    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  47.12 
 
 		 544 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  45.73 
 
 		 544 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  45.18 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  41.51 
 
 		 528 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  43.98 
 
 		 534 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  42.28 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.57 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  43.64 
 
 		 495 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  40.4 
 
 		 520 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  41.67 
 
 		 524 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.62 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  38.92 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  40.79 
 
 		 542 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  38.18 
 
 		 529 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 		 529 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 544 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  40.6 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 		 535 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  38.2 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  38.39 
 
 		 532 aa  335  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 		 534 aa  333  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 527 aa  332  8e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 		 517 aa  326  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 536 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  38.62 
 
 		 531 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.55 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  36.04 
 
 		 560 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  39.01 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  35.17 
 
 		 522 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.95 
 
 		 529 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  35.27 
 
 		 516 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  38.07 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 537 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 		 531 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 528 aa  297  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 539 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  35.03 
 
 		 536 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  35.76 
 
 		 533 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  34.4 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 530 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  33.95 
 
 		 538 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 		 532 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  35.88 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  34.91 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  34.56 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 535 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  32.14 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 538 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  45.54 
 
 		 259 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.38 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.84 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 534 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 539 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 565 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 551 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.33 
 
 		 492 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.49 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.87 
 
 		 511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.62 
 
 		 541 aa  163  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 		 576 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 517 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.04 
 
 		 505 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 580 aa  157  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.58 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 492 aa  153  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 564 aa  153  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 516 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>