More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2655 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  68.16 
 
 
538 aa  781    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  64.67 
 
 
533 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  57.14 
 
 
540 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  68.77 
 
 
538 aa  784    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  65.31 
 
 
534 aa  714    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  72.07 
 
 
546 aa  816    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  70.5 
 
 
540 aa  786    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
539 aa  1111    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  50.78 
 
 
576 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  49.36 
 
 
565 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  50.2 
 
 
563 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  44.28 
 
 
551 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 
498 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  38.11 
 
 
559 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  35.61 
 
 
501 aa  323  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  49.53 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 
508 aa  270  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  32.6 
 
 
509 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  32.63 
 
 
554 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  34.44 
 
 
553 aa  253  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.28 
 
 
505 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
526 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.22 
 
 
532 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.14 
 
 
511 aa  236  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 
557 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 
622 aa  236  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.22 
 
 
511 aa  234  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 
619 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  30.22 
 
 
510 aa  232  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.43 
 
 
524 aa  230  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.94 
 
 
580 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  27.94 
 
 
579 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
527 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  31.08 
 
 
518 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  31.16 
 
 
520 aa  224  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  31.26 
 
 
524 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
512 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
512 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
512 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 
544 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
618 aa  220  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.76 
 
 
511 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.43 
 
 
510 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.63 
 
 
511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 
534 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
544 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 
628 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 
502 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.22 
 
 
556 aa  212  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.14 
 
 
511 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 
510 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
528 aa  209  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 
600 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  30.98 
 
 
518 aa  209  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
608 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 
528 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 
545 aa  207  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.99 
 
 
594 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.54 
 
 
534 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.48 
 
 
520 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
517 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.26 
 
 
509 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
593 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
544 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.34 
 
 
534 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.83 
 
 
528 aa  204  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.28 
 
 
516 aa  203  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.83 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.76 
 
 
529 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.83 
 
 
528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.64 
 
 
528 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.64 
 
 
528 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.65 
 
 
529 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  29.12 
 
 
495 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.76 
 
 
529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.73 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.8 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  29.73 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 
544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.29 
 
 
516 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 
549 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
505 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.11 
 
 
541 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
544 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
575 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
522 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.74 
 
 
562 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 
554 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
556 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
575 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
586 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 
528 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.89 
 
 
575 aa  193  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.11 
 
 
515 aa  193  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 
524 aa  193  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  27.09 
 
 
575 aa  193  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  27.09 
 
 
575 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>