More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0910 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 555 aa  1133    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  37.3 
 
 		 549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 		 527 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.42 
 
 		 538 aa  256  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.99 
 
 		 540 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 565 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 540 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.86 
 
 		 546 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.54 
 
 		 534 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 563 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.06 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 551 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 559 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.74 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 533 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 522 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.2 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  28.8 
 
 		 522 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.48 
 
 		 539 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.51 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.31 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 498 aa  189  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 536 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 544 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.74 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 501 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.44 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  26.03 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  28.15 
 
 		 560 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 526 aa  179  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.29 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  27.13 
 
 		 558 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.37 
 
 		 556 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 		 528 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 530 aa  177  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 539 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.16 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 537 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.33 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.06 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 530 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.17 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.64 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  27.09 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  27.2 
 
 		 534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.6 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.49 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  28.81 
 
 		 533 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 533 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.1 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 515 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.35 
 
 		 532 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  25.55 
 
 		 518 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.92 
 
 		 516 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.52 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.68 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.35 
 
 		 520 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 575 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.32 
 
 		 529 aa  160  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.24 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.9 
 
 		 575 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.35 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.35 
 
 		 575 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.34 
 
 		 575 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 556 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.15 
 
 		 528 aa  157  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 555 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>