More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1669 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 510 aa  1038    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  90.18 
 
 		 511 aa  898    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  59.22 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  60.77 
 
 		 523 aa  591  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  56.24 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  56.24 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  56.24 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  55.27 
 
 		 510 aa  568  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  55.36 
 
 		 515 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  58.64 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  52.49 
 
 		 516 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  38.3 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.98 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  30.92 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  30.92 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.92 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  30.92 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.87 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  32.72 
 
 		 503 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  31.49 
 
 		 546 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  32.97 
 
 		 508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 490 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 502 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 595 aa  213  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 		 500 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  32.89 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.04 
 
 		 509 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.67 
 
 		 527 aa  210  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.73 
 
 		 516 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.51 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  29.94 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  31.57 
 
 		 502 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 492 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  32.45 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.63 
 
 		 524 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 525 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 492 aa  203  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.95 
 
 		 531 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.92 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  36.21 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 501 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 		 516 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.13 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.13 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.28 
 
 		 504 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 532 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.93 
 
 		 520 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 509 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.75 
 
 		 541 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 522 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 534 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 531 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.23 
 
 		 535 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 531 aa  193  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 		 534 aa  193  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  31.11 
 
 		 502 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  31.97 
 
 		 529 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 489 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.04 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  30.32 
 
 		 502 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.48 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 531 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 537 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.77 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 		 540 aa  190  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 539 aa  189  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.8 
 
 		 505 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.43 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.72 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.22 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.22 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.22 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.22 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  32.7 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  30.73 
 
 		 552 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 533 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>