More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4848 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 539 aa  1096    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  42.67 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  41.89 
 
 		 550 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5044  extracellular solute-binding protein family 5  40.5 
 
 		 566 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  39.47 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  38.35 
 
 		 552 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 559 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.44 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.41 
 
 		 559 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 511 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 523 aa  163  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.72 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  29.66 
 
 		 504 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.71 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.24 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 515 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.75 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 503 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 520 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6010  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 502 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 509 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 495 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.47 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  27.52 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 489 aa  141  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.04 
 
 		 509 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.81 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.81 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.81 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.14 
 
 		 504 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.25 
 
 		 513 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.62 
 
 		 521 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 508 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.18 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 534 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  26.83 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 512 aa  135  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.16 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 520 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 504 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 503 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.57 
 
 		 502 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 		 492 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 519 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  26.62 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.62 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.62 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 495 aa  133  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.62 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.62 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.62 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.62 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.79 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.58 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.58 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 517 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.85 
 
 		 517 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 494 aa  130  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 529 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 520 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 509 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>