More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2847 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  83.43 
 
 		 495 aa  851    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  100 
 
 		 495 aa  1013    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  52.62 
 
 		 490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  49.47 
 
 		 502 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  47.57 
 
 		 502 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  49.17 
 
 		 500 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  50.1 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  47.4 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  45.7 
 
 		 498 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  39.01 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  38.07 
 
 		 552 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  30.4 
 
 		 517 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  32.56 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 521 aa  224  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.53 
 
 		 534 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.97 
 
 		 535 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 519 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 536 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2811  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 540 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.87 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.34 
 
 		 520 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.45 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 512 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 512 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 512 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3427  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 526 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 502 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 516 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.94 
 
 		 520 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 523 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.12 
 
 		 521 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.12 
 
 		 521 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.12 
 
 		 521 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 521 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.92 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 527 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  32.93 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.83 
 
 		 508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.63 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 514 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 508 aa  180  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 544 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 517 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 516 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 517 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.94 
 
 		 531 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 530 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.1 
 
 		 503 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 503 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 544 aa  176  9e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 520 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  28.57 
 
 		 523 aa  172  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.18 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 519 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 505 aa  170  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.68 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.21 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.14 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 538 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 		 508 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.8 
 
 		 492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.58 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.26 
 
 		 524 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.19 
 
 		 516 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.94 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.63 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.78 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.09 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.63 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>