More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5083 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  100 
 
 		 495 aa  1014    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  83.43 
 
 		 495 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  55.42 
 
 		 490 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  48.99 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  47.07 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  48.15 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  46.75 
 
 		 498 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  49.2 
 
 		 503 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  44.61 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  40.24 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  36.83 
 
 		 552 aa  323  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 517 aa  256  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 521 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  30.86 
 
 		 536 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 		 519 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.34 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.52 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  31.08 
 
 		 527 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.06 
 
 		 520 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.75 
 
 		 509 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  30.12 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.12 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  30.12 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 		 502 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 510 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.33 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.92 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  30.06 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.5 
 
 		 508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 517 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 528 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2811  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 		 514 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 508 aa  183  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 514 aa  183  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 520 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 		 508 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3427  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 520 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 520 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 		 517 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 544 aa  177  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.91 
 
 		 523 aa  176  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.97 
 
 		 531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.99 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.79 
 
 		 479 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.22 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  28.96 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.8 
 
 		 524 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 532 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 544 aa  170  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 534 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.39 
 
 		 525 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.29 
 
 		 520 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 538 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  29 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.09 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  29 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  29 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>