More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3804 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  75.74 
 
 
509 aa  812    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
509 aa  1038    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 
505 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  34.67 
 
 
520 aa  243  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 
528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  32.55 
 
 
497 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  34.67 
 
 
509 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
495 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.65 
 
 
521 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.65 
 
 
521 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.65 
 
 
521 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.65 
 
 
521 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
521 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.64 
 
 
531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.3 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 
527 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
512 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
512 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
512 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 
532 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
500 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.4 
 
 
541 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 
527 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
510 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  32.51 
 
 
509 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
515 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  33.62 
 
 
532 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 
528 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  31.03 
 
 
502 aa  184  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
532 aa  183  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
520 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
528 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
535 aa  180  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  30.1 
 
 
502 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 
512 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  30.49 
 
 
503 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
490 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 
534 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.64 
 
 
490 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 
510 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.11 
 
 
528 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
508 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
524 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
528 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 
513 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
530 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
533 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 
516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 
517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 
517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 
544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.23 
 
 
535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
541 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
519 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
541 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
520 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  34.46 
 
 
509 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
564 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 
492 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  27.57 
 
 
537 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
498 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
559 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 
544 aa  170  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.9 
 
 
513 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
511 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.69 
 
 
512 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.69 
 
 
512 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.69 
 
 
512 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.5 
 
 
512 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  27.83 
 
 
520 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
519 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.96 
 
 
502 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.9 
 
 
508 aa  169  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.12 
 
 
512 aa  169  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.5 
 
 
512 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  30.3 
 
 
495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  28.26 
 
 
537 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  28.37 
 
 
495 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.92 
 
 
512 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 
532 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.92 
 
 
512 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.92 
 
 
512 aa  167  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.92 
 
 
512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.49 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
514 aa  166  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 
516 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
538 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.82 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>