More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3401 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  81.48 
 
 
515 aa  829    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
512 aa  1038    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
512 aa  1038    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  80.56 
 
 
510 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  69.72 
 
 
510 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
512 aa  1038    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  60.16 
 
 
516 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  55.21 
 
 
510 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  57.7 
 
 
511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  54.27 
 
 
523 aa  529  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  52.88 
 
 
512 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  35.56 
 
 
505 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.04 
 
 
517 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.13 
 
 
520 aa  247  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 
502 aa  240  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 
534 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.49 
 
 
509 aa  236  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 
528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 
519 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.58 
 
 
535 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
522 aa  227  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  33.55 
 
 
524 aa  223  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  35.32 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 
539 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.01 
 
 
538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.91 
 
 
540 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
538 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 
505 aa  219  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  31.63 
 
 
546 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.77 
 
 
492 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 
492 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 
508 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 
495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.83 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.82 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 
514 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  32.94 
 
 
529 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 
521 aa  209  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  34.19 
 
 
496 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 
492 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 
496 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
510 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
525 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 
493 aa  207  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.26 
 
 
540 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  32.59 
 
 
523 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
501 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
595 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.83 
 
 
521 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
551 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.4 
 
 
503 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.14 
 
 
534 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.86 
 
 
521 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.86 
 
 
521 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
521 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.86 
 
 
521 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  35.92 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 
500 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 
503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
494 aa  200  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
528 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.75 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.99 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
498 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
495 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.98 
 
 
541 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 
540 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 
533 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 
502 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  33.19 
 
 
497 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
509 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.06 
 
 
520 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
516 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.91 
 
 
516 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
509 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 
544 aa  191  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
508 aa  191  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
552 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
509 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.53 
 
 
530 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 
516 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  31.65 
 
 
532 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.41 
 
 
490 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 
515 aa  186  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.56 
 
 
513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  28.98 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
512 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
519 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.31 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.92 
 
 
535 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 
565 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  26.86 
 
 
527 aa  183  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>